Enciclopedia Libre được thành lập bởi những người từng đóng góp cho Wikipedia tiếng Tây Ban Nha, người quyết định bắt đầu một dự án độc lập. Được lãnh đạo bởi Edgar Enyedy, họ rời khỏi Wikipedia vào ngày 26 tháng 2 năm 2002 và tạo ra trang web mới, do Đại học Seville cung cấp miễn phí, với các bài viết được cấp phép tự do của Wikipedia tiếng Tây Ban Nha.[2]

Những lý do cho sự chia tách được giải thích trên Enciclopedia Libre.[3] Các vấn đề chính bao gồm mối quan tâm về kiểm duyệt và khả năng quảng cáo trên Wikipedia.[4] Từ cuộc phỏng vấn với Edgar Enyedy,[2] lý do chính để chia tách tại thời điểm đó là:

• Nhận thấy rằng Wikipedia sẽ sớm bắt đầu lưu trữ quảng cáo.[2]
• Wikipedias không phải tiếng Anh đang chạy các phiên bản cũ hơn, ít tính năng hơn của MediaWiki. Khi các nhóm quốc gia đề nghị giúp đỡ trong việc phát triển và bảo trì phần mềm, quyền truy cập vào các máy chủ đã bị từ chối.
• Các cơ sở dữ liệu có thể tải xuống của nội dung Wikipedia đã rất lỗi thời.
• Wikipedia đã được lưu trữ trên một tên miền.com chứ không phải là một tên miền .org.